MEDLINE收录1966年以来的包含医学、护理、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献1600万余条书目数据(2005年数据),记录的标记为[PubMed-indexed for MEDLINE]。这些数据来源于70多个国家和地区的4800多种生物医学期刊,近年数据涉及30多个语种,回溯至1966年的数据涉及40多个语种,90%左右为英文文献,70%~80%的文献有著者撰写的英文摘要。
In Process Citations 1996年8月开始,每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为[PubMed-in process]。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时,每星期转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。