低成本SCI文章思路推荐—基因家族分析

　　生物信息学发展迅猛，公共数据库中存放着海量的数据，如何利用这些公共数据结合自己的实验发一篇SCI？基因家族分析无疑是个低投入、高产出的好选择。今天我们就拿2018年发表的一篇文献跟大家聊聊这类文章是怎么做的！（文末有视频教程）

　　纵观全文，其主要的分析内容包含了常规的基因家族流程分析、转录组表达量分析及荧光定量PCR分析，文章刊发在2018的《BMC Genomics》（IF为3.7）上，下面是文章解读：

　　1、通过HMM搜索然后确定包含ACD domain的序列，并且分子量在15–42kDa范围之内，鉴定到48个马铃薯Hsp20基因家族成员。

　　2、分析了Hsp20基因家族成员在进化上的关系，构建进化树时添加了水稻、大豆、水稻、杨树的Hsp20基因并且将StHsp20-29去掉（与其他序列的差异太大），进化树分成了12个亚族。

　　3，Hsp20 基因结构，将基因结构与进化树及motif汇整了一张图片。

　　5、与胁迫相关的启动子区域顺式作用元件预测，利用在线工具（）搜索了Hsp20基因家族成员启动子区域的顺式作用元件，发现StHsp20s除StHsp20-41外至少具有一种与胁迫相关顺式元件。

　　6、利用转录组数据对Hsp20基因家族成员进行表达分析，除了StHsp20-2和StHsp20-45之外的基因在各种组织和器官中均有表达。

　　如果您也有类似的实验材料，也想做相关的分析，可以通过下方链接进入学习，适合生信基础较弱同学。

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