是关系到其能否顺利毕业的保证。前期在论坛上看到博士毕不了业，对导师以死相逼，究其原因仅仅是因为一纸论文。发表
论文写作非一日之功。前期要阅读大量文献，并将阅读文献做一个小记，这样不会出现读完后一点儿印象都没有。更重要的是为以后的参考文献选用打下良好基础。因为你引用参考文献时要有针对性，不能乱引用。在这里我建议大家采用Endnote管理文献，该软件对文献管理与论文写作非常有用。采用该软件你可将所有的文献进行分类管理，并可在摘要内做适当记录。在书写论文时，Endnote在参考文献管理方面的优势就体现出来了，一切参考文献都是一键输入，根本不用手写。使用Endnote很简单，Endnote收录高分期刊的参考文献模板与写作模板。所以你根本不用愁格式。
如果低分的期刊没有收录其参考文献模式与写作模板，你有两个办法：一，找一个相同的参考文献模板引用。例如你投稿到ABBS，你发现Cell的文献文献格式与其相同，你只需要在Endnote插入格式内选择Cell的文献格式就可以了，一键完成。二，如果你是在找不到相同的模板，那你就自己编写吧，也很简单。在这里我就不赘述了。
阅读了大量论文，试验也做的差不多的时候。需要着手写论文了。写作论文时一定要集中时间写。在写作时不一定非要从Abstract写到Acknowledgement。你可以最后写方法与致谢，但是摘要一定字斟句酌，摘要是一篇文章的高度概括。大家在搜集信息时一般看看文章的摘要就知道这篇文章是否适合自己去阅读。文章的摘要需全面体现开展该项研究的意义的深度概括。Introduction主要是概括该领域的研究，引出待解决、需研究的问题。说明为何开展该项研究等等。材料与方法就相对好些了，详细阐述方法与步骤即可。结果与讨论也非常重要。结果部分将试验结果展开论述，一般辅以图片说明。试验图片一定要清晰，否则审稿人会让你重新进行一次试验的。说句不负责任的话，你可以拼错一个单词，但是图片不可以出现模糊或不清晰这种情况。讨论就是对结果的意义进行进一步探究。SCI期刊的讨论不像国内的文章论述起来天马行空，强调言简意赅。
稿件分为综述性文章与实验性文章。投稿时首先对自己的论文有一个准确的定位，这就需要阅读大量的文献，掌握目前该领域研究到了什么状态，研究的热点是什么。你的工作对当前研究有什么意义。期刊是读者交流的主渠道，很多科学家在从事类似研究，有很多未解决问题困扰着他们，如果你的研究能对这些困扰提出一个论据，哪怕是一个细小分支。你的这篇论文也可以投一篇IF较高的期刊。如果你对信号通路进行综述，除非是该领域的大牛进行综述，否则该综述不可能被收录，因为信号通路这一领域很难解释一个所以然。如果能解释所以然，这篇文章可以在Cell上发表。
稿件定位后，就开始选择期刊了。选期刊怎么选?在Google上搜索?那真是海底捞针了!我推荐大家每人拥有近3-5年的影响因子表格。一般期刊的影响因子的变动不大，在Excel表格内将采用IF升序或降序的方法排列。如果你觉得你的文章可以投稿到1分的期刊，那么你就在IF为1的期刊列内搜索，找到生物学、医学、药学领域的期刊，一次多找几个。然后到期刊的官方网站去看该期刊的征稿范围(Scope)，确保范围准确。
首先一定要注意杂志的发表范围，超出范围的千万别投，要不就是浪费时间；另外，每个杂志都有他们的具体格式要求，一定要按照他们的要求把论文写好，免得浪费时间。
JBC：要求数据详尽，方法变化多，论点要小，但做得要深入，若有一两种新方法作为亮点更好，但不强调创新。
PNAS：idea第一，文章第二，方法也不必过多，但方法最好有些新意，但结论一定是全新的!做的不必过深入。
Science：idea第一。但Science文章确实牛，简洁!idea绝对是创新无比，而且数据极有说服力(数据量并不大)，与PNAS相比，创新方面更强，另外，数据论证更严密。
Cell：创新必需的。而且任何一个结论，至少要从三个不同角度证实它，否则免谈。另外强调深，精，许多Cell文章不是这个领域的都看不懂。
JCI：医学方面经常投的杂志。与Lancet与新英格兰比，差一个档次，但是也是一流的杂志了，14分，它强调基础研究与临床结合。不象前两本杂志，若是基础研究，水平就得类似Cell那样，或是临床方面，就得是大规模研究，或极度创新的或突破性进展，否则免谈。
但JCI简单了，如果用基础研究的方法论述临床某一个常见的问题，基本就可以搞定。但是如果仅仅做临床，那是难发表的，不过JAMA倒可以考虑，但那是有门户之见，不是一般人能投成功的。
另外，投稿时，有许多杂志稿源不够(主要是发表量大，而且SCI分数不高，2-4分之间)，他们审稿特松，如Brain Research，BBRC，Brain，Pain等，这类杂志审稿松得要命，因为稿源严重不足!基本只要写作没有太多的问题，投去很快能接收，而且发表极快，但是文章水平就不好说了。另外，做科学，有几种说法，有idea的大牛人，那是发表CNS文章的。
如果没有呢，那就做做模仿或gap junction的工作，也可以混日子，模仿和gap junction工作，也能发表6分以下的文章还是行的。但是一定要跟上时代，老是找最新的东西模仿，不过这样基本难以形成自身实验室的特色了，也不会形成一个较为全面的体系。
由于每个期刊都有各自的特色和风格，所以我们在准备SCI投稿的时候就需要根据“Instructions for Authors”，修改自己文章的格式。
现在Elsevier、Springer、Wiley这些数据库等均采用在线投稿的模式，所以投稿者需对投稿系统有所了解。第一次投稿由于不熟悉投稿界面，经常会出现一些意想不到的问题，这个多操作几次就熟练了。每种期刊的系统不同，但是原理是相通的。一般在投稿时会需要写作Cover Letter，这个需要事先写好，到时候复制、粘贴就可以了。后续的交流主要是通过邮箱进行，所以邮箱一定是常用邮箱，这个很重要。
cover letter要简单介绍你的工作的创新性，这样便于论文的快速发表，当然也应该客气几句，让编辑感到心里舒服，主要是夸杂志好之类的话；有人写cover letter，就是写上题目、然后说很荣幸投稿之类地话，也有人干脆把摘要全写上，这样并不好，一定用两到三句话说明你论文“新”在哪，这个非常重要。
（1）向编辑简要介绍一下论文的内容以及参与此项研究工作的作者名单。在这里不需要太详细，即使是工作中包含了一些复杂的实验部分。
（2）重点解释为什么该研究是有创新性的而且会受大家感兴趣。在这里，可以介绍有哪些创新性的技术被用到、你的实验样本数量足够多、研究成果将对这个领域有较大影响等。一些临床国际期刊还要求介绍这项工作会对将来的实际治疗应用的意义。需要注意的是写作时只需要包含要点而不用仔细解释。同时，尽量让编辑看到你的工作是和所投期刊相关性很强。最好是你的工作也刚好验证了别的研究团队在这个期刊以前发表的成果，或者与他们结果相反。
（3）可以介绍你和你的研究团队：主要研究人员，实验室的研究方向，以及与这篇文章的关系。可以解释为什么要选择这个期刊来投稿。如果此项工作有与其他实验室合作完成，也可以介绍相关合作团队的研究情况。
（4）声明文章没有任何利益方面的冲突(查询各期刊在利益冲突政策方面的描述，因为每个期刊有不同的相关规定)。同时，需要表明这项研究没有发表过，也没同时在别的期刊投稿。
最后，英语不好没关系，是人都知道我们英语没英国和美国人地道，但只要能表达清楚你要表达的意思就好了。
一般情况下，投稿一周内会收到期刊编辑的邮件，会告知你的稿件已经给了审稿人。文章审理工作就此开始了。审稿人对你的论文进行评述，然后将意见反馈给期刊编辑，后者将意见反馈给你。一般审稿人都会有两名，给出的意见采用概率分析方法无非就这么几种：当然有些期刊存在3名评审人员的可能，这里就不多说了。道理是一样的!
恭喜你，你的论文进入到了minor revision(小修)阶段。离文章发表仅有一步之遥了!当然不能大意，有些进入到这一环节也被拒稿的。只需要按照评审人的要求仔细修改，发表应该没问题。
这是常见的，称之为manor revision(大修)。这里你要做的就是将差评的内容进行修改，并逐条进行回复。请注意是逐条修改，逐条回复。优评的如果有要求，你也要回复。同样的处理。回信时你需要告诉编辑，建议采用分条的方法，逐条列出。这样条理清晰。
如果你修改的符合评审人员的要求，你就进行minor revision或者直接发表。如果不符合要求，你的结果就是拒稿。
理论上你存在转变为大修与小修的可能，但实际上可能性不大。你需要转投其他稿件了。
稿件派给审稿人到审稿人给出回复时间(也就是编辑给你回复的时间)差不多在25天左右。大修与小修给的时间分别不同，大修的时间有时候跟稿件派给审稿人到审稿人给出回复时间相同，小修时间会短一些，但不排除与稿件派给审稿人到审稿人给出回复时间相同的可能。
在这里我还想特别指出，几乎所有的作者都有过被拒稿的经历。事实上，在作者一方如果不是需要发表文章的时限特别紧急(比如急着毕业或者要拿来做评定职称的参考)，作者在第一次投稿的时候不妨把目标期刊定得稍高些。
一般来说，高水平杂志(high-profile journals)的审稿周期比较短。决定文章是否被期刊采纳的最最主要的因素当然是文章的质量和意义，但是这其中有时也有些些儿运气在。通俗的说，第一次投稿可以“碰碰运气，”就算失败，损失的不过是一个审稿周期的时间(比如两个星期到一个月)。而如果文章真入了审稿专家和编辑的法眼，能在高影响因子的期刊上发表，对作者可谓益处多多。当然，也要注意不同的期刊对文章的格式和字数方面的要求会有所差异。
一般一篇文章被一个期刊拒稿后原稿件不经过修改是不能直接投到另一个期刊的。但是，这种修改一般只是格式上的，不需要花费太多的时间(注：影响因子超高的几个期刊，比如nature和science，对篇幅的限制非常苛刻，要求文章短小精悍，所以如果被这种杂志拒稿，再投下一个目标期刊的时候往往需要对稿件进行扩充，补充之前被省略的细节或次要实验)。
说说论文接收后的工作吧，就是移交版权(你将出版权出让给期刊)。这时候官方的互动就不是你的事儿了，导师会跟那边交流。需要你的他自然会去找你。期刊一般会有稿酬，一般100-200美金。这笔费用你拿不到。因为期刊建议你不要拿这笔费用，因为他们在来信说编辑与审稿人很辛苦，这笔费可以给他们买点儿礼物。导师会顺水做个人情，告诉你这个钱咱不要了。那时觉得论文发表很开心，所以这钱就不要了。哈哈!有彩页的要交钱，费用不低，不过不用担心，只要你论文发表了，这钱导师出。
版权出让，拿到接收函后过一阵子期刊排版，会给你一份稿件让你校对，看是否有错误。没错误那里就准备发表了，之后你就等着期刊在线刊登吧！
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