Genome Biology 7月内容更新

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专题文章

灵长类谱系中增强子进化的功能研究

　　 Klein与同事们监测并识别了灵长类动物肝脏增强子功能进化的轨迹。他们发现了84个与增强子功能相关的、在CpG岛内富含胞嘧啶脱氨基的等位基因突变体。这很可能就是进化的来源。

上位基因分析揭示了潜在的抗生素抗性适应成本对MRSA进化的抑制效果

　　 Yokoyama和同事们展示了对莫匹罗星的抗性赋予了编码IleRS酶的基因突变，这对金黄色葡萄球菌蛋白质组具有多效性影响。

外显子芯片的Meta分析识别出了与心脏传导相关的新基因座、包括ADAMTS6

　　 通过以人口为基础的大规模外显子芯片分析，Prins与同事们确定了心室去极化与ADAMTS6里的罕见非同义变异的关联。他们认为这些变异体在调节间隙连接介导的心室去极化中具有独特作用。

内容目录

评论文章和综述

　　 综述：从波形曲线到碱基对：提高纳米孔测序读取准确性的计算方法

　　 Rang, Kloosterman and de Ridder

　　 综述：肿瘤发展进程中机体内部变化的时间顺序

　　 Jolly and Van Loo

　　 观点：RNA切割的异质性：如何区分信号和噪声

　　 Wan and Larson

　　 研究荟萃：将基因组浏览器便携化、个体化

　　 Khan and Zhang

　　 通信：阿尔茨海默病诊断中健康老化基因的表达特征：一份随机的抽样研究

　　 Jacob and Speed

研究

　　 研究论文：一个大规模的全基因组测序分析揭示了水稻中Cas9和Cpf1（Cas12a）核酸酶对基因组的修饰具有高度特异性

　　 Tang et al.

　　 研究论文：逆转录转座子BovB和L1在真核生物中的水平转移

　　 Ivancevic et al.

　　 研究论文：另类DNA二级结构的形成造成人类RNA聚合酶II在启动子端的停滞

　　 Szlachta et al.

　　 研究论文：DNMT3A和TET1协同调节小鼠胚胎干细胞中启动子的表观遗传

　　 Gu et al.

　　 研究论文：外显子芯片的Meta分析识别与心脏传导相关的的新基因座、包括ADAMTS6

　　 Prins et al.

　　 研究论文：上位基因分析揭示了潜在的抗生素抗性适应成本对MRSA进化的抑制效果

　　 Yokoyama et al.

　　 研究论文：差异基因表达分析工具对长非编码RNA的测序数据的分析的表现不尽如人意

　　 Assefa et al.

　　 研究论文：Wnt基因在自由和保守的脊索动物基因组中的演化与功能编排

　　 Somorjai et al.

　　 研究论文：灵长类谱系中增强子进化的功能研究

　　 Klein et al.

　　 研究论文：DNA拓扑异构酶I有差异地调控人类基因组中的R环

　　 Manzo et al.

　　 研究论文：染色质环锚与肿瘤基因组的不稳定性和生殖细胞重组高发位点有关

　　 Kaiser and Semple

　　 研究论文：大量线粒体DNA基因参与的杂交对基因组的影响

　　 Seixas, Melo-Ferreira and Boursot

　　 研究论文：靠自然选择驱动的对于转录本的优化来调节基因在细菌中的进化速率是最有经济效益的

　　 Seward and Kelly

软件

　　 GIVE：为个人网站设计的便携基因组浏览器

　　 Cao et al.

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　　 • Genome Biology是一本开放获取期刊，读者群广泛。

　　 • 在JCR基因遗传学门类下排名第2——在同门类开放性杂志中排名第1

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　　 （来源：科学网）

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