工程T细胞的抗癌能力依赖于它们迁移到肿瘤附近,增殖并且杀伤肿瘤细胞的能力。因此,除了通过基因工程给予T细胞对肿瘤抗原的性,增强其安全性和有效性以外,T细胞本身的特性也会对疗效有影响。对T细胞的进一步分析发现T细胞包括初始T细胞( T cell,TN),T记忆干细胞(memory stem T cell,TSCM),中央记忆T细胞(central memory T cell,TCM),效应记忆T细胞(effector memory T cell,TEM),组织驻留记忆T细胞(tissue resident memory T cell,TRM) 和效应T细胞(effector T cell,TE) 等T细胞亚型。T细胞的分化过程为从TN逐步分化成TSCM和TCM,这些细胞可以增殖,并且进一步分化成时间较短的TEM和TE细胞。这一分化途径意味着选择分化程度较低的TN, TSCM或TCM作为基因工程的原材料可能产生疗效更高的工程T细胞。
目前为止所有成功的TCR和CAR-T疗法使用的都是自体细胞。这一选择的原因是为了防止注入的T细胞宿主或者宿主T细胞疗法。但是使用自体细胞不可避免地带来生产流程上的困难和不同患者之间的疗效差异性。使用同种异体T细胞的挑战在于如何避免或减少移植物抗宿主病(graft versus host disease, GVHD)。免疫药物虽然可以减少GVHD的症状,但是并不适用于工程T细胞疗法,因为T细胞的抗癌作用需要不受免疫系统阻碍。
目前有三种防止GVHD的策略:第一种方法移植过的造血干细胞或T细胞前体而不是成熟的T细胞,这可以使注入的T细胞建立起对宿主的免疫耐受。但是这种方法需要患者具有正常的胸腺功能。第二种方法是选择那些造成GVHD风险较小的T细胞进行,例如病毒性T细胞(virus specific T cell, VST)。第三种增加同种异体细胞安全性的方法是去除这些细胞中的TCR。这可以通过TCR的α或β链来完成。但是这三种手段只能防止CAR-T细胞不宿主的健康组织,它们没有解决宿主的免疫系统同种异体细胞的问题,因此在临床应用方面的效果有限。